1.1.Thefeasibilityofmetagenomicnext-generationsequencingtoidentifypathogenscausingtuberculousmeningitisincerebrospinalfluid.
4.FrontMicrobiol.Sep3;10:.
?入组23例结核性脑膜炎（TBM）患者，其中12例为TBM，11例基于评分系统以及抗结核的疗效临床诊断为TBM。另外，选取6例细菌、真菌、病毒性或自身免疫性脑膜炎患者作为阳性或阴性对照。与不同的结核诊断方法学相比，回顾性探究和评估mNGS在TBM诊断方面的价值。
?23例TBM患者CSF检测阳性率：培养4.35%（1/23），抗酸染色36.36%（8/22），PCR15.79%（3/19），mNGS78.26%（18/23）。
?mNGS有望作为结核性脑膜炎的一线诊断方法，与传统方法学联合，将会最大化提升检测阳性率。
1.2.Metagenomicnext-generationsequencingofcerebrospinalfluidforthediagnosisofcentralnervoussysteminfections:amulticentreprospectivestudy.（Biorxiv,）
?脑脊液mNGS检测在中枢神经感染的多中心前瞻性研究。纳入临床表现为脑炎/脑膜炎及三天内标准诊断学方法不能够鉴定感染病原的成年患者，随访30天。病人信息、用药史、实验室检测数据（微生物数据以及传统检测的数据）、神经影像结果、疗效信息、治疗的反应均被收集。
?从例患者中排除11例系统性血管炎、自身免疫性脑炎、原发性中枢神经系统淋巴瘤等非感染性疾病的患者。以染色、培养、PCR和血清学等传统检测为金标准，将mNGS结果分为真阳性、假阳性和假阴性结果3大类，评估mNGS临床应用效能。
?例患者通过mNGS检测到特定病原(36.6%)，包括11种病原微生物、7种病毒、2种真菌、2种寄生虫。五种检测率最高的病原分别是：水痘痘状疱疹病毒、结核分枝杆菌、单纯疱疹病毒、EB病毒、新型隐球菌。
?mNGS检测脑脊液是一种强有力的检测中枢神经系统感染的方法。
1.3.Clinicalmetagenomicsequencingfordiagnosisofmeningitisandencephalitis.
70.67NEnglJMed.Jun13;(24):-.
?为期1年8家医院例患者的研究中，通过正交实验测试证实了脑脊液样本的mNGS在诊断传染性脑膜炎和脑炎的有效性。
?在57例感染中，19例用传统和mNGS方法均检测出病原体。
?mNGS方法未检测出的26例感染中，11例使用血清学方法，有7例通过脑组织非CSF样本诊断，8例由于CSF中病原体浓度过低。
?在13例仅mNGS检出的案例中，7例检出（54%）帮助临床启动对症治疗，1例（8%）协助确诊EBV相关的淋巴瘤及排除混合感染，1例检出奈瑟菌（8%）增强了临床决策的信心，2例（15%）肠病毒的检出及分型可用于流行病学分析，1例MW多瘤病毒检出未有明确的临床意义，1例圣路易斯脑炎病毒检出再次确认了该病毒的感染。
?临床mNGS有助于改善对神经系统感染的诊断和治疗。
1.4.Ametagenomics-baseddiagnosticapproachforcentralnervoussysteminfectionsinhospitalacutecaresetting.（Biorxiv,）
?大概有15%-60%的脑炎以及70%的脑膜炎不能够确认病原。目前，对于中枢神经系统的感染主要的检测方法是脑脊液革兰氏染色、细胞计数、葡萄糖/蛋白质的测定、降钙素元（PCT）、乳酸，用于区分细菌和病毒的感染。PCR用于检测特异性的病原，但依赖于预判。
?对74份怀疑感染的脑脊液样本进行检测，这些样本之前进行过培养/PCR鉴定，检测的准确定性、灵敏性及特异性都达到95%。
?mNGS可以用于中枢神经系统的诊断。
1.5.Anovelcauseofchronicviralmeningoencephalitis:cachevalleyvirus.
9.AnnNeurol.Jul;82(1):-.
?免疫缺陷患者易患神经感染性疾病且难以诊断。
?一名来自澳大利亚的34岁X连锁无丙种球蛋白血症男性患者，3年脑膜脑炎病史，一系列传统方法检测（包括脑组织活检）均未能确定致病原。
?利用mNGS对脑脊液及脑活检组织进行检测。鉴定出多种卡奇谷病毒（CacheValleyvirus）的基因，随后利用RT-PCR及免疫组化方法确认了脑活检组织中存在卡奇谷病毒。
?卡奇谷病毒通常由蚊虫携带，有记录表明此病毒仅3名北美急性神经感染性疾病患者中检测到。
1.6.Diagnosingbalamuthiamandrillarisencephalitiswithmetagenomicdeepsequencing
9.AnnNeurol.Nov;78(5):-30.
?一名眼内感染继发脑膜炎的74岁女性病例，对其脑脊液进行mNGS检测，鉴定出阿米巴虫。
?PCR复核患者的脑脊液、脑组织及玻璃体液都检测到阿米巴虫，而免疫学及血清学检查均呈阴性。
1.7.Diagnosisofneuroinvasiveastrovirusinfectioninanimmuno
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